Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL161901.1-201ENST00000624954 3425 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 STMN2-201ENST00000220876 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RALYL-211ENST00000523850 1684 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 PFKFB2-202ENST00000367080 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 KRTAP23-1-201ENST00000334160 211 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HEATR1-201ENST00000366579 793 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR12D3-201ENST00000396806 1869 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL357752.1-201ENST00000412817 349 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GPC5-AS2-201ENST00000417589 401 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HMGB3P24-201ENST00000433260 622 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC01158-205ENST00000458253 747 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SL174P-201ENST00000475578 289 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AP005436.1-201ENST00000531454 488 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL136298.1-202ENST00000556520 518 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SL787P-201ENST00000613000 284 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DNAJC10-209ENST00000613960 1010 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC021422.1-201ENST00000621212 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AP4S1-212ENST00000622409 4113 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC098679.1-203ENST00000505532 2227 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CD200R1L-204ENST00000488794 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 MIR323B-201ENST00000385269 82 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC093155.2-201ENST00000420734 937 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPS23P6-201ENST00000466136 431 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RPS17P15-201ENST00000475609 349 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 RN7SL273P-201ENST00000481561 299 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AP001804.1-201ENST00000526868 919 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
CDH18Q13634 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
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