Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TTTY2B-201ENST00000450591 3168 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TTTY4B-201ENST00000420149 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TTTY4-201ENST00000436568 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TTTY4C-201ENST00000456123 1346 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZFY-202ENST00000383052 5113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR12D2-207ENST00000642051 1496 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CACNB4-225ENST00000636442 4232 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF625-ZNF20-201ENST00000430024 2651 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GON4L-204ENST00000437809 7713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 BRD8-204ENST00000411594 2967 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 DCAF10-201ENST00000242323 7393 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TMEM132B-206ENST00000613307 9659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CAGE1-203ENST00000379918 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RNU1-84P-201ENST00000365447 164 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 IGLV3-16-201ENST00000390311 385 ntAPPRIS P1 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RBMS3-AS1-201ENST00000414547 554 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL031767.1-201ENST00000426374 386 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL157400.1-201ENST00000428166 368 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MORF4L1P5-201ENST00000433352 961 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC245452.2-201ENST00000435222 392 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL138899.2-201ENST00000439139 499 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RPL37P23-201ENST00000492641 294 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC022075.2-201ENST00000535911 562 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ASXL1-208ENST00000555343 1034 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC244034.2-201ENST00000562504 509 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC007496.2-201ENST00000564801 547 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AP005230.1-204ENST00000579097 779 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC135178.4-201ENST00000585275 548 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 MIR7515HG-235ENST00000590865 918 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL034549.1-201ENST00000615120 578 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL591926.1-201ENST00000620542 217 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AL122023.1-201ENST00000622847 530 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC01435-220ENST00000630847 714 ntTSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC010325.3-201ENST00000641084 394 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CASC19-212ENST00000641153 1287 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AXDND1-214ENST00000617277 3405 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 NBPF8-201ENST00000583271 5330 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 LINC01613-201ENST00000561476 2780 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 DNAJC15-201ENST00000379221 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 ZNF679-202ENST00000421025 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 SELP-203ENST00000367788 2427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GJA10-203ENST00000638915 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GLYATL1P1-201ENST00000528297 1607 ntBASIC6.98□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 GOLGB1-201ENST00000340645 11187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 DNA2-203ENST00000399180 3207 ntTSL 2 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
DUSP4Q13115 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.97□□□□□ -1.29
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