Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TNP1-201ENST00000236979 407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LIX1L-AS1-202ENST00000412239 570 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC245060.4-201ENST00000413293 1121 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MIR4435-2HG-209ENST00000441075 704 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CYP3A43-210ENST00000444905 733 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NXT1P1-201ENST00000458481 316 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC103876.1-202ENST00000561498 369 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 THSD4-AS1-201ENST00000561571 554 ntTSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC007601.2-201ENST00000566957 502 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MRO-208ENST00000588444 866 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.36□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ZNF610-208ENST00000613461 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ELOC-201ENST00000284811 683 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TMA16P2-201ENST00000413187 601 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BX679664.2-201ENST00000439282 283 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC01880-201ENST00000446593 561 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 CAMSAP2-201ENST00000236925 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 PDE4B-203ENST00000371045 3982 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 DBT-201ENST00000370131 1521 ntTSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RNU1-150P-201ENST00000362491 162 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RNU105B-201ENST00000364478 208 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 KRTAP29-1-201ENST00000391353 1026 ntAPPRIS P1 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC7.34□□□□□ -1.23
CHAF1AQ13111 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC7.34□□□□□ -1.23
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