Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CBX1P3-201ENST00000413296 527 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL359636.1-201ENST00000433572 522 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC007099.1-201ENST00000451622 1185 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 APOBEC3AP1-201ENST00000511396 287 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC009779.8-202ENST00000607990 932 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC00484-208ENST00000609752 591 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC004808.2-201ENST00000627965 773 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 SLC26A3-201ENST00000340010 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 KCNQ3-205ENST00000621976 10659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 SLC38A9-218ENST00000512595 1756 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MARCH7-201ENST00000259050 5922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 REP15-201ENST00000310791 1078 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
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PTP4A2Q12974 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MED21-206ENST00000546323 575 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 CYCSP38-201ENST00000559840 322 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LYRM1-211ENST00000569023 769 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC008507.3-201ENST00000585753 472 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC010320.2-201ENST00000593857 551 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 MIR6780B-201ENST00000610307 79 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
PTP4A2Q12974 AC022417.1-201ENST00000624768 1303 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
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