Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SCARNA9-201ENST00000530422 353 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AAGAB-203ENST00000542650 1015 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC02400-201ENST00000548210 351 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 COPZ1-205ENST00000548753 778 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 COPZ1-218ENST00000553231 551 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC100767.2-201ENST00000604840 693 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL356608.1-201ENST00000610034 820 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 WBP1LP8-201ENST00000617401 327 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PRRC1-204ENST00000512635 2726 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MT-RNR2-201ENST00000387347 1559 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC068389.1-202ENST00000526470 3564 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPL7-204ENST00000396467 1526 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SCN1A-209ENST00000635750 8299 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR7A10-201ENST00000248058 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPL7P58-201ENST00000402913 758 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC012499.1-201ENST00000412133 741 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 KCNMA1-AS3-201ENST00000418515 701 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 ATP13A4-AS1-202ENST00000431512 394 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 LINC01456-201ENST00000453902 708 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RN7SL197P-201ENST00000466981 299 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 EFCAB10-203ENST00000480514 740 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC090204.1-202ENST00000500843 737 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OSMR-AS1-201ENST00000506463 800 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 SNHG1-211ENST00000539921 1071 ntTSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 AC008149.1-201ENST00000551844 525 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
RPS29P62273 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.24□□□□□ -1.89
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