Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 EPGN-201ENST00000332112 847 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL391422.1-201ENST00000402155 436 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL391987.2-201ENST00000421848 492 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ALG13-AS1-201ENST00000430794 195 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LDHBP2-201ENST00000456969 1005 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC026992.1-201ENST00000558269 571 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 MRPS21P7-201ENST00000566937 238 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 MIR6729-201ENST00000618194 65 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 PATJ-203ENST00000371158 8505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL390036.1-202ENST00000634635 2439 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 TTC39B-207ENST00000507993 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 EIF3EP2-201ENST00000423042 1814 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 FAM240A-201ENST00000444264 1826 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 FAM240A-202ENST00000640551 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 OSER1-202ENST00000372970 1616 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC068870.1-201ENST00000563737 2455 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 EEF1A1P33-201ENST00000554413 1362 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ZSCAN12P1-201ENST00000406489 419 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 GAPDHP42-201ENST00000406848 981 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 TNPO1P1-201ENST00000423641 1138 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC012075.1-201ENST00000436549 580 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 CYCSP51-201ENST00000443545 318 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LINC02057-202ENST00000511794 577 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 MINCR-206ENST00000524335 499 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC009063.2-203ENST00000567860 745 ntTSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ANGPT2-201ENST00000325203 5416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.38□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RCAN2-201ENST00000306764 3240 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 PRLR-203ENST00000348262 1339 ntTSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 COX7B2-202ENST00000396533 617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC005323.2-201ENST00000399342 583 ntTSL 3 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC092811.1-202ENST00000433058 656 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 PPIAP20-201ENST00000449839 135 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL589674.2-201ENST00000604304 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 TULP3P1-203ENST00000606237 586 ntTSL 4 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
TMPOP42166 KIAA0391-209ENST00000604948 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms