Protein–RNA interactions for Protein: P35452

HOXD12, Homeobox protein Hox-D12, humanhuman

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12P35452 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 CYCSP52-201ENST00000422857 310 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AL691517.1-201ENST00000440833 1235 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AL023584.2-201ENST00000454411 444 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AL136982.3-201ENST00000454709 688 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC093763.1-201ENST00000512464 699 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC066613.1-201ENST00000559977 1053 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AP000904.1-201ENST00000609911 951 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 AC016907.2-203ENST00000455424 3563 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 CHORDC1-201ENST00000320585 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 HHLA2-206ENST00000467761 2379 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 SAGE3P-201ENST00000619800 1635 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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HOXD12P35452 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
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HOXD12P35452 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
HOXD12P35452 PRRC2C-202ENST00000367742 10366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.4
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HOXD12P35452 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
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HOXD12P35452 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 DNAJC16-202ENST00000375847 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 CLEC7A-203ENST00000310002 425 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 GAPDHP15-201ENST00000398586 975 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 UBE2V1P15-201ENST00000407776 448 ntBASIC6.27□□□□□ -1.41
HOXD12P35452 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC6.27□□□□□ -1.41
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