Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 802 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 GLYATL1P2-202ENST00000588046 902 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LINC01359-206ENST00000634775 888 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CNTRL-212ENST00000613863 2418 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 POTEH-AS1-201ENST00000422014 2566 ntTSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PPP2R3A-201ENST00000264977 6795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SLC7A6-216ENST00000618043 6124 ntTSL 5 BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MGAT4A-201ENST00000264968 8432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.75□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZMAT1-206ENST00000540921 3139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ARMC3-203ENST00000409049 2479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 NOVA1-204ENST00000465357 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SIPA1L1-203ENST00000537413 4129 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 APOOL-203ENST00000622540 6466 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 INTS2-201ENST00000251334 4255 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF639-201ENST00000326361 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 PDGFRA-206ENST00000508170 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 OPALIN-203ENST00000393871 3545 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CYP2C8-212ENST00000623108 1962 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC022075.1-201ENST00000500682 2830 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC118754.1-201ENST00000416958 370 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 LMCD1-AS1-202ENST00000439407 576 ntTSL 4 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPL7P41-201ENST00000485823 957 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 CREM-242ENST00000490511 469 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AC079385.3-201ENST00000552415 809 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TRIM69-208ENST00000560442 1262 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL157778.1-201ENST00000626665 729 ntTSL 3 BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 GANC-201ENST00000318010 7781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 ZNF846-202ENST00000586293 1621 ntTSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.74□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 CD46-204ENST00000357714 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 CD200R1-202ENST00000308611 2299 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 ANKRD36BP2-207ENST00000622311 5398 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 ANGPT2-204ENST00000629816 2602 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 ADH6-203ENST00000394899 2802 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
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PTPRAP18433 CSTA-201ENST00000264474 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 FASLG-201ENST00000340030 917 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 TRIM55-203ENST00000350034 1177 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC017035.1-201ENST00000411999 1115 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
PTPRAP18433 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
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