Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 LINC00701-201ENST00000418295 742 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AP000949.1-201ENST00000438328 629 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL162739.1-201ENST00000450606 307 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL445687.2-201ENST00000458156 728 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 Y_RNA.667-201ENST00000516212 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 GLYATL1P2-201ENST00000529451 510 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 NPM1P5-201ENST00000557228 838 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC067773.1-201ENST00000603284 1094 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AJ009632.2-209ENST00000634853 933 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 PKIB-207ENST00000392491 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 FOXP2-204ENST00000390668 1472 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 GLRA2-204ENST00000443437 3182 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 CLEC12A-201ENST00000304361 1549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL589655.1-201ENST00000405398 482 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL390879.2-203ENST00000426943 1121 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL392003.1-201ENST00000434394 243 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 Z99916.1-201ENST00000454253 482 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL356272.1-201ENST00000454538 832 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 TMED11P-203ENST00000502630 533 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC010181.1-202ENST00000509191 798 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 VEPH1-219ENST00000537559 992 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 TMEM202-202ENST00000567679 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC018761.4-201ENST00000585742 272 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 ZNF484-201ENST00000332591 2836 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 BDNF-205ENST00000395981 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 GDNF-AS1-202ENST00000510986 1941 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 LRRC37B-204ENST00000543378 3091 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
CTPS1P17812 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
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