Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 LAPTM4BP1-201ENST00000447781 690 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RHEBP2-201ENST00000450289 600 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC104078.2-201ENST00000504344 541 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SNX18P23-201ENST00000510867 677 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP003306.1-201ENST00000529875 353 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR4A21P-201ENST00000532759 944 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC084816.1-202ENST00000536744 647 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ULK4P1-202ENST00000565174 503 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MDFIC2-201ENST00000567252 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 STRADA-207ENST00000578008 1153 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC015911.3-201ENST00000592908 849 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 TEX41-218ENST00000596540 882 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC019257.2-201ENST00000605539 497 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 EDRF1-AS1-210ENST00000613304 569 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CYLC1-202ENST00000621735 379 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR10X1-201ENST00000623167 981 ntAPPRIS P1 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL049767.1-201ENST00000636811 514 ntTSL 5 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CFHR5-201ENST00000256785 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SYT1-212ENST00000552744 2718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 HOXD8-202ENST00000429017 1608 ntTSL 2 BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 C14orf37-201ENST00000267485 6495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MGC4859-201ENST00000634803 3118 ntTSL 1 (best) BASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC7.63□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ZMYND8-216ENST00000471951 4053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MMS22L-201ENST00000275053 8643 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ACKR2-201ENST00000422265 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NXF4-202ENST00000416098 1465 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SLC24A1-212ENST00000546330 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 FBXW12-204ENST00000445170 1379 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 STAG2-201ENST00000218089 5218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ESRP1-204ENST00000454170 3482 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NAALAD2-201ENST00000321955 3035 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR7G2-202ENST00000641081 3015 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 NCR3LG1-201ENST00000338965 6438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PIH1D3-201ENST00000336387 993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 C1orf194-203ENST00000369948 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 EEF1AKMT1-201ENST00000382754 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CAV1-204ENST00000393470 598 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL359962.1-201ENST00000417969 303 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC116038.1-201ENST00000432250 408 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 LIX1L-AS1-206ENST00000447686 846 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC135721.2-201ENST00000464237 300 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MARK2P8-201ENST00000476069 952 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CPHL1P-204ENST00000482639 584 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 PTTG2-201ENST00000504686 691 ntAPPRIS P1 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 DOCK2-211ENST00000520908 4654 ntTSL 2 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AP000842.2-202ENST00000526211 569 ntTSL 4 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC125612.1-201ENST00000547580 377 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MT1CP-201ENST00000567054 174 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC026461.2-201ENST00000568608 244 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC025682.1-201ENST00000582389 437 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC011443.1-201ENST00000599484 365 ntTSL 3 BASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
HOXD8P13378 AC111186.1-201ENST00000604684 130 ntBASIC7.62□□□□□ -1.19
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