Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 IL1RL1-202ENST00000311734 3994 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RTL9-203ENST00000540313 5225 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NDUFS1-205ENST00000449699 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 GPR89A-213ENST00000534502 1644 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC001226.2-204ENST00000638101 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MAPK10-270ENST00000641102 3538 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PSMA6-201ENST00000261479 1029 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RPL11P4-201ENST00000332269 436 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 DNAJC12-202ENST00000339758 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TINAG-202ENST00000370864 692 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC079355.1-201ENST00000421770 223 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 VN1R38P-201ENST00000450265 887 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC074286.1-201ENST00000452002 544 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC016687.1-201ENST00000482574 353 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC124945.1-201ENST00000485133 188 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC139491.3-201ENST00000509643 684 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC140125.1-201ENST00000515739 684 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CHCHD7-210ENST00000521524 703 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC02454-201ENST00000539116 589 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 LINC00921-201ENST00000572123 243 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AP000919.2-202ENST00000584431 673 ntTSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CBLN2-208ENST00000584764 543 ntTSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TTN-AS1-219ENST00000586707 834 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL136084.2-212ENST00000589976 654 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MIR6085-201ENST00000618314 110 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC103703.1-201ENST00000634783 663 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 GPR1-209ENST00000612892 2565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CD200R1-201ENST00000295863 1692 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CDKAL1-204ENST00000613575 1673 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 IPO8-209ENST00000544829 3212 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC005702.3-201ENST00000585345 1447 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PLRG1-202ENST00000499023 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC107980.1-201ENST00000558671 3355 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NF1-201ENST00000356175 12362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 SLC9A6-212ENST00000637195 4858 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 EEF1A1P21-201ENST00000512363 1344 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC009779.8-201ENST00000641684 4384 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 PDE4D-228ENST00000636120 6659 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 NBPF12-205ENST00000617614 4630 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 GOLGA6L22-204ENST00000622895 4178 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FTO-215ENST00000636491 1676 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 TRAV25-201ENST00000390454 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AC009506.2-201ENST00000420635 840 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC6.72□□□□□ -1.33
USP18Q9UMW8 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
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