Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9B8

RASGEF1A, Ras-GEF domain-containing family member 1A, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1AQ8N9B8 AC098859.2-201ENST00000506232 563 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 HMGN2P47-201ENST00000559378 272 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL096712.1-201ENST00000614561 159 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SNX18P12-201ENST00000624821 759 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ZBTB38-222ENST00000637056 6056 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 GCSAML-201ENST00000366488 3820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC012358.3-203ENST00000366287 1110 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RPL23AP17-201ENST00000401064 499 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SYCE3-202ENST00000406915 448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 HMGN1P20-201ENST00000411849 300 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PIWIL4-203ENST00000537419 831 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SH3BGRL-201ENST00000373212 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SLC12A6-218ENST00000560611 4239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 KCNT2-203ENST00000451324 3146 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ACOD1-202ENST00000449753 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 CLEC2D-201ENST00000261339 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 RNA5SP500-201ENST00000364486 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 ANAPC15-205ENST00000535503 734 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
RASGEF1AQ8N9B8 AC092121.1-201ENST00000569452 202 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.9 ms