Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 IBTK-210ENST00000610980 5195 ntTSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 FOXP1-212ENST00000491238 2250 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MDM4-215ENST00000614459 9782 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KIAA0232-202ENST00000425103 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ADGRL3-204ENST00000506720 4962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SLC39A12-202ENST00000377371 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 MDM4-204ENST00000367183 9098 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ERC1-204ENST00000397203 9118 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL138733.1-201ENST00000415477 853 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC092801.1-201ENST00000443763 581 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 GRIK1-AS1-205ENST00000455392 767 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC093001.1-201ENST00000489011 551 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC090458.1-203ENST00000527757 546 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC00871-204ENST00000556886 866 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CSNK1A1-210ENST00000606719 835 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC016542.2-201ENST00000624201 619 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PDE4DIP-206ENST00000369356 8307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ASCC1-203ENST00000342444 2270 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ZC3H13-201ENST00000242848 8018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KIAA1958-203ENST00000536272 7650 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 KAT6B-204ENST00000372724 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SLC17A2-203ENST00000377850 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 NF1-202ENST00000358273 12425 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR7D2-202ENST00000641288 3248 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 TMEM170B-201ENST00000379426 8362 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OR2J2-202ENST00000377167 1272 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 CXCL8-202ENST00000401931 700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL157385.1-201ENST00000446973 268 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
PTF1AQ7RTS3 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 ADAM7-204ENST00000520720 1870 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 NFATC3-202ENST00000346183 6040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 TMEM99-201ENST00000301665 2058 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 EYA4-206ENST00000431403 2154 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC007938.2-201ENST00000604666 2634 ntBASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 FYB1-204ENST00000505428 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 RTN4-203ENST00000357376 4110 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 FOCAD-216ENST00000605086 4195 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 IBTK-201ENST00000306270 6054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 ZBTB21-205ENST00000398511 5608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 RNF146-215ENST00000616343 2077 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AL136979.1-201ENST00000421645 1120 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 DPPA3P2-201ENST00000553589 478 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC106730.2-201ENST00000566641 540 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC074050.3-201ENST00000569175 441 ntTSL 4 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC026992.2-201ENST00000570122 766 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
PTF1AQ7RTS3 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms