Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 LINC01787-201ENST00000435311 1994 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.62□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 NCOA7-202ENST00000368357 5521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 CLEC2B-201ENST00000228438 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 CC2D2B-201ENST00000344386 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OR7E25P-201ENST00000344844 931 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GRIK2-203ENST00000369134 4185 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SMC4P1-201ENST00000414479 527 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 USP24P1-201ENST00000433802 779 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 HLA-DPA3-207ENST00000454398 229 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC090568.1-201ENST00000509499 856 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC090888.3-201ENST00000558917 509 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 NOVA1-213ENST00000574031 1431 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC099850.2-201ENST00000577660 557 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AP001962.1-201ENST00000624114 559 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC00850-201ENST00000629221 685 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LINC01602-201ENST00000522992 2109 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RNF150-202ENST00000420921 3673 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 POLE2-206ENST00000554396 1581 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ESRRG-204ENST00000361525 5363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 FETUB-203ENST00000382136 1040 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 VN1R3-201ENST00000418822 919 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AK4P4-201ENST00000419465 646 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 NAP1L4P3-201ENST00000432820 1147 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC084048.1-201ENST00000505494 640 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC008663.1-201ENST00000519821 455 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 IGKV1OR22-1-201ENST00000521497 360 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 NANOGNBP2-201ENST00000544753 553 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC068305.2-201ENST00000550567 1205 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
NDUFA9Q16795 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms