Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 TAF13-201ENST00000338366 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SAMD13-206ENST00000394834 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CCDC17-203ENST00000445048 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AP002754.2-201ENST00000542121 462 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01906-201ENST00000582962 499 ntTSL 4 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC092574.1-201ENST00000609771 420 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 5S_rRNA.28-201ENST00000638107 119 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CSNK1G1-204ENST00000606793 1658 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 CSTF3-201ENST00000323959 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 OR5B2-202ENST00000641342 2184 ntAPPRIS P1 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 ST20-201ENST00000478497 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SPINK13-202ENST00000511106 661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 LINC02319-201ENST00000555852 349 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 AC018558.1-201ENST00000562591 459 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 AC090844.2-201ENST00000578802 436 ntTSL 4 BASIC8.03□□□□□ -1.12
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CNGB1Q14028 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 FGF1-214ENST00000612258 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF521-201ENST00000361524 4871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 DDX1-208ENST00000621973 2183 ntTSL 5 BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.03□□□□□ -1.12
CNGB1Q14028 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 LRRC39-202ENST00000370137 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 CCNE2-202ENST00000396133 1361 ntTSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 LINC01760-201ENST00000423410 382 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC008073.2-201ENST00000428344 792 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 HTR3E-AS1-201ENST00000431427 515 ntTSL 4 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC004692.2-201ENST00000457315 355 ntTSL 3 BASIC8.02□□□□□ -1.13
CNGB1Q14028 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC8.02□□□□□ -1.13
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