Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC009019.1-203ENST00000568603 515 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MIR6774-201ENST00000614651 70 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CCL4L2-217ENST00000620250 667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AL162726.3-201ENST00000637606 1301 ntTSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.33
CUL4AQ13619 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SATL1-202ENST00000509231 2224 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ZNF23-207ENST00000564528 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TRAV8-7-201ENST00000390456 341 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 HIST1H3PS1-201ENST00000404612 417 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NIFKP3-201ENST00000417799 865 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 THEM7P-201ENST00000419556 672 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RPS26P24-201ENST00000497656 331 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC138409.2-202ENST00000507274 458 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC025766.1-201ENST00000514061 409 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC009879.1-201ENST00000520029 839 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 C5orf58-205ENST00000524171 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CT45A3-202ENST00000598716 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 C5orf63-208ENST00000607731 478 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC108673.3-201ENST00000609183 335 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC243960.7-201ENST00000623532 707 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ELMO1-207ENST00000442504 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 GLYATL1-201ENST00000300079 2068 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 KCNJ2-201ENST00000243457 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 GPR52-201ENST00000367685 1088 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 FAM183DP-201ENST00000421987 399 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 BCAP29-207ENST00000445771 1157 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC112484.3-201ENST00000505910 329 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CUL4AQ13619 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
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