Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 FASTKD2-201ENST00000236980 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PRG4-204ENST00000445192 5044 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 CNOT1-202ENST00000441024 4999 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL662874.1-201ENST00000426065 230 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC009963.4-201ENST00000448535 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC02327-205ENST00000550990 472 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC087565.3-203ENST00000641018 837 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 YPEL5-202ENST00000379519 2499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC127164.1-201ENST00000548738 4196 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SREK1-203ENST00000380918 2433 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SYCP2L-207ENST00000543878 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL159987.1-201ENST00000347911 293 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 GKN1-201ENST00000377938 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC004882.2-201ENST00000420180 244 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL158825.2-201ENST00000455336 670 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 CLEC19A-204ENST00000493231 557 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MOCS2-208ENST00000527216 707 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 MS4A3-208ENST00000534744 507 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC010463.2-201ENST00000597592 661 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL157762.1-201ENST00000619612 415 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 PIGX-210ENST00000639143 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.52□□□□□ -1.36
ITGB3BPQ13352 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 NSD1-201ENST00000347982 7688 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 MRPS36-201ENST00000256441 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC022215.1-201ENST00000481770 362 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 RPL32P33-201ENST00000487023 394 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC094108.1-201ENST00000502494 527 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 AC106872.4-201ENST00000510050 523 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
ITGB3BPQ13352 HMGB1P42-201ENST00000532126 553 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
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