Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 MTAP-210ENST00000580900 7557 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 WASHC4-202ENST00000332180 5812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 THRB-IT1-201ENST00000425296 1754 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 NSD3-206ENST00000527502 4471 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ALKAL2-201ENST00000344414 449 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL731575.1-201ENST00000413564 418 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL096829.1-201ENST00000413677 457 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL109610.1-201ENST00000414598 431 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL109807.1-201ENST00000438222 569 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC098847.1-201ENST00000473094 348 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AP002370.2-201ENST00000531424 545 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC005000.1-201ENST00000536192 288 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC129507.1-204ENST00000573601 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 OCLM-201ENST00000574641 884 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL357562.1-201ENST00000624911 609 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AP002008.2-205ENST00000637111 1091 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 NXPE4-202ENST00000424261 1687 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 DCC-203ENST00000442544 10206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC004852.2-201ENST00000614289 2218 ntTSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 PAK3-203ENST00000372007 8940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ZNF146-201ENST00000443387 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ASAH1-232ENST00000636691 2472 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 GRIK1-201ENST00000327783 3179 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 SLC2A14-221ENST00000616981 3366 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC009404.1-201ENST00000420330 3090 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 CCNB1IP1P1-201ENST00000428976 839 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL158053.1-201ENST00000441503 453 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL035530.1-201ENST00000446887 331 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 SLC25A51P1-201ENST00000468432 871 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AP000873.2-204ENST00000530825 375 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC040918.1-201ENST00000560056 632 ntTSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC009097.1-201ENST00000567077 406 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AP001172.1-201ENST00000602921 581 ntTSL 3 BASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
SEMA3BQ13214 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132 ms