Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AP000897.2-201ENST00000579509 1057 ntTSL 3 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC025278.1-201ENST00000593558 515 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OR7A1P-201ENST00000601206 970 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC104695.2-201ENST00000605056 775 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 UOX-205ENST00000640983 544 ntTSL 4 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL357153.1-201ENST00000500016 2941 ntTSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.42□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NFAT5-202ENST00000354436 13229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC01793-201ENST00000409590 2036 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL049872.1-201ENST00000556323 322 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC01125-220ENST00000599501 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 URI1-201ENST00000360605 1579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PTBP3-202ENST00000334318 7990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NOX4-214ENST00000532825 2039 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NELL2-201ENST00000333837 2943 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 U3.10-201ENST00000364459 214 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 GABARAPL3-201ENST00000412799 354 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 SLC48A1-205ENST00000547002 751 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 AC099654.11-201ENST00000638857 294 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
TMPOP42166 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 CASC15-206ENST00000606851 1889 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 GSTCD-202ENST00000394728 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
TMPOP42166 TMED10-201ENST00000303575 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 UGT2B15-201ENST00000338206 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AL158152.1-201ENST00000602652 1435 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
TMPOP42166 AC110716.2-201ENST00000563865 3945 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms