Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 UGP2-232ENST00000640075 567 ntTSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 CLUL1-205ENST00000579494 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.6□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 FIGN-202ENST00000409634 746 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 RPL12P43-201ENST00000420608 499 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 DPYD-AS2-201ENST00000422259 788 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 RPL36A-206ENST00000471855 399 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 RN7SL193P-201ENST00000491708 276 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 RPL36A-209ENST00000553110 429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CT47B1P0C2W7 AQP4-201ENST00000383168 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
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CT47B1P0C2W7 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.19
CT47B1P0C2W7 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.59□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC7.59□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 GPR85-202ENST00000424100 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AP2B1-211ENST00000610402 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CT47B1P0C2W7 AIMP1-202ENST00000394701 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CT47B1P0C2W7 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CT47B1P0C2W7 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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CT47B1P0C2W7 C1DP3-201ENST00000455013 423 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 CST12P-201ENST00000457644 362 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC011405.1-204ENST00000512875 731 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC100863.1-201ENST00000584843 560 ntTSL 4 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AL031665.2-201ENST00000620712 209 ntTSL 3 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 SATB1-AS1-243ENST00000627546 589 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 CCR2-201ENST00000292301 2671 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 CAP1P2-201ENST00000417455 1409 ntBASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 AC008080.4-201ENST00000420185 1589 ntTSL 2 BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.2
CT47B1P0C2W7 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC7.58□□□□□ -1.2
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