Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FASTKD1-204ENST00000453153 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSPA8P18-201ENST00000439846 1928 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C6orf10-210ENST00000617061 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC8B-201ENST00000330947 7593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CEP164P1-202ENST00000456938 2472 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL513548.1-201ENST00000562904 1724 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYHIN1-204ENST00000392252 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSU1P2-203ENST00000448600 1582 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR15-201ENST00000284311 1252 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RGS5-202ENST00000367903 934 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL6-203ENST00000401651 539 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP221-201ENST00000410420 301 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z68694.1-201ENST00000413929 841 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC093107.1-201ENST00000422772 609 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL050344.1-201ENST00000424084 490 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIP7P1-201ENST00000433227 512 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NANOGP9-201ENST00000439890 892 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133351.3-201ENST00000454998 193 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011225.1-201ENST00000457751 369 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018980.1-201ENST00000457848 862 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC139769.1-201ENST00000471224 1001 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL702P-201ENST00000488394 292 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP303-201ENST00000516192 130 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010834.1-201ENST00000517998 696 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO16-207ENST00000518734 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PMS2P3-207ENST00000529061 717 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC084121.1-201ENST00000533882 835 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC025419.1-204ENST00000539653 745 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1AP9-201ENST00000550710 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCAT29-202ENST00000558941 545 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR1273F-201ENST00000580581 99 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC012593.1-208ENST00000587791 696 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008592.5-201ENST00000607856 547 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STARD13-AS-247ENST00000610879 779 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005514.1-201ENST00000623521 208 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02060-201ENST00000506041 1626 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTR1F-201ENST00000319595 3140 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL157895.1-201ENST00000451713 1404 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT5-202ENST00000378937 919 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD9-203ENST00000403056 1155 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL12P23-201ENST00000405880 490 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL604028.1-201ENST00000430643 598 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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