Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC009299.1-201ENST00000429684 717 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 HSFX3-201ENST00000431993 1264 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 DEFA9P-201ENST00000433042 285 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 FO393419.1-201ENST00000443746 355 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AP002856.1-201ENST00000447864 562 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC007879.2-201ENST00000454444 551 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL19P-201ENST00000462522 306 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC018816.1-206ENST00000474544 455 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02040-201ENST00000481004 556 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 HSD17B11-203ENST00000507286 851 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC100823.2-201ENST00000518337 699 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC055860.1-201ENST00000525523 688 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 BRD9P1-201ENST00000529855 560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02308-201ENST00000555001 637 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 LINC02157-201ENST00000558885 447 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC087501.3-201ENST00000576477 513 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 MIR3137-201ENST00000577367 75 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 C17orf80-208ENST00000582793 531 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL138924.1-201ENST00000629067 415 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 AC097478.1-206ENST00000513572 2010 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 YME1L1-201ENST00000326799 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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TRIM35Q9UPQ4 KLHL8-203ENST00000498875 5175 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 STON2-209ENST00000614646 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 TXNRD1-219ENST00000529546 2018 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 OR9Q1-201ENST00000335397 2488 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 RABEP1-201ENST00000341923 2490 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 C3orf30-201ENST00000295622 1814 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
TRIM35Q9UPQ4 AC027097.2-201ENST00000588925 1976 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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