Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

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Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 HAUS3-201ENST00000243706 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 GNL2P1-201ENST00000451274 2190 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC015799.1-201ENST00000622996 3122 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 NEPNP-201ENST00000404786 1371 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 NEGR1-202ENST00000357731 12811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 OR2B6-201ENST00000244623 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 OR5B17-201ENST00000357377 946 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL512593.1-201ENST00000444758 779 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL355032.1-201ENST00000472981 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 CASP5-209ENST00000531367 879 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 PCNAP4-201ENST00000532690 730 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RPA2P3-201ENST00000533268 770 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC016911.1-201ENST00000613297 452 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC018793.2-201ENST00000639584 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC018793.3-201ENST00000640805 585 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 NCOR1-202ENST00000395848 3106 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 NFIB-204ENST00000380953 2381 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 LINC00326-202ENST00000457339 2515 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 PSD3-202ENST00000327040 11689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 ESRRG-208ENST00000391890 5542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC092692.1-201ENST00000623625 2595 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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HDAC6Q9UBN7 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC022173.1-201ENST00000418554 577 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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HDAC6Q9UBN7 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 TUBB4BP6-201ENST00000437576 479 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC117386.1-201ENST00000474444 606 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
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HDAC6Q9UBN7 LECT2-205ENST00000522943 574 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC068389.4-201ENST00000531379 689 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC078878.1-201ENST00000539832 958 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RNU4ATAC-201ENST00000580972 127 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AL136131.3-201ENST00000607600 188 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
HDAC6Q9UBN7 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
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