Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 ZNF480-204ENST00000490272 2238 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 METTL6-203ENST00000443029 4020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PSG10P-201ENST00000501199 1500 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 WFDC8-202ENST00000357199 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 KIF4CP-201ENST00000422742 1279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC105021.1-201ENST00000455347 590 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AP003396.4-201ENST00000527574 265 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC134980.1-214ENST00000638815 687 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 C2CD6-201ENST00000286195 2104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC012078.1-201ENST00000405035 1646 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC117409.1-201ENST00000470499 1310 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TRIM69-202ENST00000338264 1222 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 RPS14P4-201ENST00000415880 418 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC005077.1-201ENST00000449226 375 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 JCHAIN-204ENST00000510437 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC090155.1-201ENST00000520800 407 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 WBP1LP3-201ENST00000523033 208 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC02392-201ENST00000548172 537 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AP005119.1-201ENST00000580956 292 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC005244.1-201ENST00000582566 339 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC011468.3-201ENST00000597886 332 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC125494.2-201ENST00000602431 657 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 MIR6813-201ENST00000621638 56 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 LINC01125-249ENST00000627399 1067 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 N4BP2L2-204ENST00000399396 2872 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 SPATA6-202ENST00000371843 2297 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
IMPG1Q17R60 AP005435.3-201ENST00000531260 3198 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 LINC01581-202ENST00000558874 3173 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
IMPG1Q17R60 AL449283.1-201ENST00000602631 3403 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms