Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DDX6-208ENST00000620157 6152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DOCK9-208ENST00000448493 7887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CDKL4-201ENST00000378803 1567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 BLM-201ENST00000355112 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 FSHR-202ENST00000406846 2784 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 NFIA-204ENST00000371187 2683 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ZRANB3-211ENST00000619650 2494 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC073342.2-201ENST00000595842 1800 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RNU6-386P-201ENST00000362650 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RPS3AP2-201ENST00000407190 754 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC068631.1-204ENST00000428501 534 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CUBNP2-201ENST00000443534 1139 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SNORD46.2-201ENST00000516021 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 IGKV2-4-201ENST00000523070 340 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AP001381.1-201ENST00000584109 534 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CCL4-202ENST00000615863 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DNAH17-201ENST00000389840 13723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ZNF615-204ENST00000594083 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RFTN2-201ENST00000295049 5827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 Z93929.1-201ENST00000418200 1475 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 IFNE-201ENST00000448696 1475 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DLG2-207ENST00000398309 7890 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 C3orf35-203ENST00000425564 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 DPCR1-202ENST00000462446 5314 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 OR2W1-201ENST00000377175 1028 ntAPPRIS P1 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 TYRP1-201ENST00000381136 872 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL360271.1-201ENST00000395679 510 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL139039.2-201ENST00000407436 479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 MTND6P12-201ENST00000428247 522 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
FAM187BQ17R55 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.7 ms