Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PTPRZ1-201ENST00000393386 8175 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC009095.1-201ENST00000388909 1326 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MLH1-206ENST00000435176 2428 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 CHN1-201ENST00000295497 2047 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SEPT14P12-201ENST00000442280 560 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC002553.3-201ENST00000453002 341 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC005017.1-201ENST00000482002 490 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 CR383658.1-201ENST00000514609 734 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 VPS29-210ENST00000552130 1057 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 DCTN5-207ENST00000568272 523 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ING3-204ENST00000431467 1447 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 WDR12-201ENST00000261015 8100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 GTF2IRD2P1-202ENST00000618962 3055 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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SYCP1Q15431 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
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SYCP1Q15431 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC01620-204ENST00000623295 700 ntTSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 SCRN1-210ENST00000631335 423 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 DAOA-202ENST00000375936 742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC02528-202ENST00000434437 535 ntTSL 2 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RPL12P49-201ENST00000441100 121 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AL590652.1-201ENST00000453790 850 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC6.47□□□□□ -1.37
SYCP1Q15431 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.47□□□□□ -1.37
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