Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TRAPPC11-209ENST00000512476 2546 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 SNX18P3-202ENST00000565670 1750 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR56A3-201ENST00000329564 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 C1orf194-202ENST00000369945 534 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 HNRNPA1P18-201ENST00000433537 927 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RAET1E-AS1-201ENST00000446954 491 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 SORCS3-AS1-201ENST00000449805 1278 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC093166.4-201ENST00000457867 318 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 LINC00518-204ENST00000491317 1228 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC008448.1-201ENST00000505109 584 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 MGAT4D-203ENST00000511113 1125 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC026894.1-201ENST00000532930 850 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 AL138895.2-201ENST00000603019 178 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 RBMS3-AS2-206ENST00000629296 438 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.38
ALCAMQ13740 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF571-202ENST00000358744 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC106799.3-201ENST00000562127 3300 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TNFSF11-202ENST00000358545 1520 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 BDNF-210ENST00000438929 4059 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FGG-201ENST00000336098 1659 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR4S2-201ENST00000312422 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RPS21P8-201ENST00000413365 247 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MOB4-207ENST00000448447 1021 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC132807.1-201ENST00000449613 458 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC135999.1-201ENST00000478962 479 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PDE4D-225ENST00000515835 590 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RNU6-1334P-201ENST00000516032 105 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RNA5SP271-201ENST00000516700 88 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF322P1-201ENST00000568013 1209 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 FAM27E4-201ENST00000605259 342 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC092378.1-202ENST00000500117 2296 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC113146.2-201ENST00000560743 1961 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PROM1-201ENST00000447510 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC023490.2-201ENST00000359859 470 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AL157938.2-207ENST00000415391 884 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 PCBP2P1-201ENST00000437262 977 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC019117.1-202ENST00000439046 589 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 UQCRB-204ENST00000518406 595 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC136944.1-201ENST00000567464 560 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
ALCAMQ13740 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
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