Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 MIR6823-201ENST00000622118 61 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CUL3Q13618 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CTSV-203ENST00000538255 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 PAGE2B-201ENST00000374971 493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LYZL1-201ENST00000375500 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL355581.1-201ENST00000415964 830 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC074035.1-201ENST00000420725 1184 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC00328-2P-201ENST00000436585 219 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC02384-202ENST00000441255 567 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC007383.1-201ENST00000445875 636 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OCIAD1-216ENST00000509122 1204 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC009803.1-202ENST00000551940 544 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 EIF1AXP2-201ENST00000555940 413 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPGRIP1L-208ENST00000566096 893 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP003774.2-201ENST00000569737 558 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP000919.1-201ENST00000582850 985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC107993.1-201ENST00000591343 684 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC244205.1-201ENST00000624935 705 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC022021.1-201ENST00000634334 843 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 BMP10-201ENST00000295379 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC019072.1-201ENST00000604535 1551 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RNA5SP279-201ENST00000365513 117 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MIR191-201ENST00000384873 92 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 VN1R20P-201ENST00000425215 966 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 C2orf80-206ENST00000451346 979 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC073409.1-201ENST00000451749 269 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC073476.1-201ENST00000452854 407 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 RN7SL612P-201ENST00000497704 295 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 CCNHP1-201ENST00000513311 678 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC036111.2-201ENST00000533247 901 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 LRTOMT-218ENST00000541614 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AL713998.2-201ENST00000604538 1198 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
CUL3Q13618 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms