Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 OR52U1P-201ENST00000439752 923 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 RPL5P22-201ENST00000480199 884 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC008708.1-201ENST00000517346 474 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 TMEM68-213ENST00000522576 826 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC069234.2-202ENST00000535720 583 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL008582.1-201ENST00000609612 442 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 SPAM1-203ENST00000402183 1860 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 PIGN-217ENST00000591238 1622 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 CASC19-238ENST00000641523 1558 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 U3.28-201ENST00000391249 210 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC008060.2-201ENST00000415333 468 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 HYALP1-201ENST00000417674 1279 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC008868.1-201ENST00000509786 737 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 IGHVII-49-1-201ENST00000521760 224 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AP002004.1-206ENST00000532441 876 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 OR9G2P-201ENST00000533326 880 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 GPRC5D-AS1-203ENST00000536029 466 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC006065.4-204ENST00000537478 654 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC006065.4-203ENST00000541065 526 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LINC00944-204ENST00000544499 366 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 Z98949.1-228ENST00000595093 798 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 ZNF415-218ENST00000599261 601 ntTSL 3 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL645933.2-201ENST00000606743 1207 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 MIR6811-201ENST00000620409 58 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 TTC33-206ENST00000636863 1149 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 P2RY14-202ENST00000424796 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 UQCRC2P1-201ENST00000417777 1332 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL049869.1-201ENST00000556933 1402 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 KRTAP19-6-201ENST00000334046 330 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 XAGE3-202ENST00000375491 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 IGHV6-1-201ENST00000390593 415 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 GPN3P1-201ENST00000423883 535 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AP003385.1-201ENST00000426387 893 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 RPS7P3-201ENST00000443360 580 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 RPS7P4-201ENST00000444127 582 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 TAS2R39-201ENST00000446620 1017 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
CASQ1P31415 AL117382.2-201ENST00000455642 403 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.1 ms