Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 LINC01958-201ENST00000637749 1941 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SDHDP6-201ENST00000414693 480 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 EEF1A1P29-201ENST00000416082 1096 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AK3P5-201ENST00000432033 519 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC002504.1-201ENST00000438281 691 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RPSAP39-201ENST00000467439 883 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC011389.1-203ENST00000513790 573 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RNU4-18P-201ENST00000516751 149 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TMEM97P2-201ENST00000517841 403 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LINC02055-205ENST00000521090 774 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF43-209ENST00000598288 560 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MIR6886-201ENST00000619864 61 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF540-201ENST00000316433 3099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZEB1-201ENST00000320985 5423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MDGA2-201ENST00000357362 2965 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 NABP1-204ENST00000410026 11521 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MOSPD2-201ENST00000380492 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 KCNMA1-AS1-202ENST00000429850 3566 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TRIP12-204ENST00000389045 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CLEC4D-201ENST00000299665 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL355306.2-206ENST00000635233 1903 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OR5W1P-201ENST00000423705 938 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 FRG2FP-204ENST00000453982 852 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LINC01448-201ENST00000455947 1171 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 NSMCE2-202ENST00000517315 996 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MRPS16P1-201ENST00000523462 412 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF418-210ENST00000600989 597 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC087468.1-201ENST00000604365 630 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 FAM72A-208ENST00000607379 1139 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TLR6-201ENST00000381950 2938 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZEB2-244ENST00000638007 9140 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MRE11-203ENST00000393241 2604 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 BCL2L14-213ENST00000589718 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SLC30A7-203ENST00000370112 7898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 NLGN4X-202ENST00000381092 3750 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MIA3-201ENST00000340535 2735 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 KCNJ1-204ENST00000392665 4074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ADAM21-201ENST00000603540 2658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RLN1-201ENST00000223862 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RC3H1-IT1-201ENST00000421851 448 ntTSL 5 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL022331.1-201ENST00000429025 477 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SRGAP3-AS4-201ENST00000449023 377 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LINC01780-202ENST00000457683 391 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC074087.1-201ENST00000512059 724 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 LINC02422-201ENST00000535163 852 ntTSL 3 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 RERGL-203ENST00000538724 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 DPPA3P2-202ENST00000557188 1219 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 MIR4505-201ENST00000582238 73 ntBASIC6.59□□□□□ -1.35
HOXA13P31271 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC6.59□□□□□ -1.35
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