Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 HSPE1P2-201ENST00000554777 306 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC114488.3-201ENST00000581333 480 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC012588.1-201ENST00000583852 358 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 LINC02341-201ENST00000637043 824 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC7.27□□□□□ -1.24
PTPRCP08575 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 GTF2IP4-201ENST00000453092 2054 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PREPL-203ENST00000378520 2308 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ECT2L-205ENST00000541398 4483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MEF2C-202ENST00000424173 6336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SCN2A-209ENST00000636071 8881 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SCN2A-214ENST00000636985 8856 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNA5SP510-201ENST00000364697 99 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SUMO2P3-201ENST00000438311 288 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ST13P12-201ENST00000508958 1094 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC139697.1-201ENST00000548429 745 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AP000842.3-201ENST00000564354 808 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC010547.6-201ENST00000571789 193 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LINC02343-201ENST00000605909 573 ntTSL 4 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL391425.1-202ENST00000617518 774 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC009135.2-201ENST00000624136 1768 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LINC02141-201ENST00000568279 6586 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MAPKAPK5P1-201ENST00000431810 1376 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 GRAMD2B-202ENST00000502348 1363 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 CAPSL-201ENST00000397366 969 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL606534.1-201ENST00000439562 694 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RPL12P11-201ENST00000439970 501 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
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PTPRCP08575 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SNHG12-207ENST00000475441 444 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
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PTPRCP08575 AC008705.1-201ENST00000518837 489 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL592430.2-201ENST00000633779 486 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 UNC79-203ENST00000553484 9100 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ZFYVE9-202ENST00000357206 4567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL031985.1-201ENST00000392713 418 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL590399.2-201ENST00000427536 309 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 HNRNPDLP2-201ENST00000455248 751 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MAL2-207ENST00000522828 603 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC107884.2-201ENST00000530963 550 ntTSL 4 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 MIR3614-201ENST00000581261 86 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 LINC00293-204ENST00000521715 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 ADGB-205ENST00000397944 5325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 NAP1L1-227ENST00000618691 13505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTPRCP08575 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
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