Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC090505.2-201ENST00000427064 464 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 HCG14-201ENST00000444986 413 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 HMGN1P36-201ENST00000446623 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC114956.1-201ENST00000504277 512 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC093535.1-203ENST00000512500 730 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC104212.3-201ENST00000522044 444 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC138907.7-201ENST00000568972 358 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 LINC01908-201ENST00000583148 555 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ODF4-202ENST00000584943 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AP001542.1-201ENST00000591314 200 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL021368.3-201ENST00000607119 578 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 GTF3C3-202ENST00000409364 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 DPH5-203ENST00000370109 1316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RASSF8-213ENST00000542865 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CR788268.1-201ENST00000603931 1809 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CD226-201ENST00000280200 12319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RAPGEF2-201ENST00000264431 6949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 PDZRN4-203ENST00000539469 3041 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL160163.1-201ENST00000417465 403 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC117434.1-201ENST00000419971 836 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC087501.1-201ENST00000445617 715 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CFL1P4-201ENST00000451536 498 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 VPS25P1-201ENST00000455691 508 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC011476.1-201ENST00000466725 307 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC008638.1-201ENST00000506035 866 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC126768.1-201ENST00000511698 490 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 RNA5SP438-201ENST00000516561 112 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 EIF4EP5-201ENST00000528228 640 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 KLRC1-204ENST00000536188 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC016180.1-201ENST00000567945 403 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC093484.5-201ENST00000585048 304 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC127024.4-201ENST00000585212 308 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AP001823.1-201ENST00000604056 1003 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC004477.3-201ENST00000614061 590 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 MALAT1-214ENST00000618925 424 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AL139220.2-221ENST00000628123 395 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 LINC02341-202ENST00000637462 1295 ntTSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
LRRTM2O43300 TGIF1-204ENST00000400167 1352 ntTSL 3 BASIC5.63□□□□□ -1.51
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