Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,791 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 TRRAP-207ENST00000628380 12644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PBRM1-203ENST00000356770 7523 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZSCAN12-201ENST00000361028 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SRPX2-201ENST00000373004 6679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LAMB4-201ENST00000205386 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 IL1RAP-202ENST00000317757 5413 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 UVRAG-205ENST00000528420 2463 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ARL14EPL-201ENST00000601302 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RN7SKP279-201ENST00000411383 298 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPSAP35-201ENST00000413753 818 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OXCT1-206ENST00000512084 1593 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MAK-202ENST00000354489 3941 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LINC01128-205ENST00000445118 6606 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ASB15-206ENST00000451558 4788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ABCA11P-202ENST00000504019 2110 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC011503.1-201ENST00000596326 1585 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CLTC-201ENST00000269122 7760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RALYL-206ENST00000521376 1457 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CCNT1-201ENST00000261900 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MYRFL-201ENST00000299350 820 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PRKACB-203ENST00000370684 869 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL589647.1-201ENST00000402485 466 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL592402.1-201ENST00000417161 440 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GAPDHP58-201ENST00000438477 1006 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 APPL2-203ENST00000546731 684 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AP005209.1-201ENST00000582531 928 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ABLIM1-207ENST00000392955 7408 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CUZD1-205ENST00000368904 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ERG-202ENST00000398897 4651 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GAGE1-204ENST00000619375 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CD164-207ENST00000504373 1402 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 OR2G6-203ENST00000641804 6084 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SLC17A8-201ENST00000323346 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZEB2-227ENST00000627532 9541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ALMS1-206ENST00000613296 12925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 SPATA31C1-201ENST00000420021 3895 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL445190.1-201ENST00000416448 288 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 HTR2A-202ENST00000542664 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 EPPIN-202ENST00000354280 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ATXN3-216ENST00000545170 6950 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 ZHX3-201ENST00000309060 10030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SCN11AQ9UI33 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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