Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL136985.3-202ENST00000636386 2708 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 STYX-202ENST00000442123 4554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MOCS2-201ENST00000361377 3568 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 DDX18P6-201ENST00000450119 1997 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC027088.4-201ENST00000611559 1947 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ANGPT1-205ENST00000520052 1523 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MAPK9-213ENST00000539014 1668 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MCM10-201ENST00000378694 4587 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TNFSF4-201ENST00000281834 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP211-201ENST00000365516 117 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 OR2L2-201ENST00000366479 1134 ntAPPRIS P1 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PRB3-201ENST00000381842 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL096800.1-201ENST00000405326 893 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC108488.1-202ENST00000439547 482 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CATSPER2P1-205ENST00000446479 419 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC008429.4-201ENST00000521201 182 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TRIM77BP-201ENST00000524985 1119 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC004551.1-201ENST00000552784 575 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ANKRD20A5P-203ENST00000580200 566 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CLEC12A-205ENST00000434319 1515 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GBA3-206ENST00000610628 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 NBPF26-201ENST00000609741 3671 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BRAFP1-201ENST00000445336 2703 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RPS24-201ENST00000360830 514 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP477-201ENST00000362639 119 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RN7SKP128-201ENST00000364270 303 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 MIR1282-201ENST00000408865 101 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL162430.2-201ENST00000422306 435 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 GAPDHP34-201ENST00000432112 823 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
COPS7AQ9UBW8 DNAJA1P5-201ENST00000440278 943 ntBASIC5.53□□□□□ -1.52
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