Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 AC012629.3-201ENST00000623397 328 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC018659.2-201ENST00000624690 715 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 OR8A1-204ENST00000642111 1145 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 ADGRB3-203ENST00000546190 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 RALYL-204ENST00000518566 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 PNPLA4-204ENST00000537427 2559 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 NFIA-201ENST00000357977 3200 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 PPP1R11-201ENST00000376758 1723 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 TMOD2-203ENST00000539962 3000 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 MEIOB-205ENST00000470044 1857 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 KARSP1-201ENST00000451871 1752 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 NCOA6-202ENST00000374796 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 CENPJ-206ENST00000616936 5020 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 TGFB2-202ENST00000366930 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SUCLG1-201ENST00000393868 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 MED1-201ENST00000300651 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 N4BP2-201ENST00000261435 9744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 TRIM53CP-201ENST00000531490 1354 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 OR1I1-201ENST00000209540 1242 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 HOMER1-201ENST00000282260 774 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 DEFB106A-201ENST00000335186 303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 DEFB106B-201ENST00000335479 316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SEC61G-201ENST00000352861 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 FAS-205ENST00000357339 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 MXI1-204ENST00000369612 879 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC019178.1-201ENST00000392337 440 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 ATP5J-206ENST00000400099 492 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL451046.1-201ENST00000406097 534 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 RN7SKP188-201ENST00000410789 317 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 RBMY2JP-201ENST00000425544 1059 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL445465.1-204ENST00000440220 447 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC244505.3-201ENST00000454598 187 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SRP68P2-201ENST00000456184 254 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC084871.1-201ENST00000508020 628 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 HOMER1-204ENST00000508576 815 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC119751.1-201ENST00000513357 765 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC079089.1-203ENST00000533300 431 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SOX9-AS1-214ENST00000540802 578 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 NDUFA5P11-201ENST00000567995 343 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC108097.1-201ENST00000568275 534 ntTSL 4 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC097467.3-216ENST00000599555 1293 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC124312.4-201ENST00000605533 310 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL356056.3-201ENST00000605984 551 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 OR2AS2P-201ENST00000606902 342 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 GOSR2-222ENST00000639031 885 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 GUCY2C-201ENST00000261170 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC010328.1-201ENST00000596769 4060 ntTSL 2 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC005618.1-201ENST00000606901 3148 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 WBP11P1-201ENST00000562560 1931 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 Z93022.1-201ENST00000433228 1554 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 OR2G6-202ENST00000641501 5840 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AC025809.2-201ENST00000625085 1802 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 MAT2B-201ENST00000280969 2226 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 KIAA0232-201ENST00000307659 7841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 TTI1-202ENST00000373448 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 AGXT2-201ENST00000231420 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 LCP2-201ENST00000046794 4678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 TLR4-202ENST00000394487 3908 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
MCMBPQ9BTE3 SCP2-212ENST00000488965 3926 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms