Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TRIM51-201ENST00000244891 1329 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DYNC2LI1-210ENST00000605786 1346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC008627.1-201ENST00000517511 1704 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PARP4P2-201ENST00000446672 3326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC093225.1-201ENST00000506867 1408 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MAPK10-370ENST00000641943 4117 ntAPPRIS P2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 C3orf14-201ENST00000232519 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TMEM31-201ENST00000319560 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TRAV13-1-201ENST00000390436 360 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 U3.23-201ENST00000391132 200 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 C2orf88-202ENST00000396974 998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 NPM1P37-201ENST00000403105 874 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC097463.1-201ENST00000447288 481 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC073072.2-201ENST00000447425 348 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SH2D1A-203ENST00000477673 461 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RAB30-209ENST00000532548 644 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 C3orf14-207ENST00000542214 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP001007.3-201ENST00000560744 356 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC090518.1-202ENST00000568246 578 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC005703.3-201ENST00000579159 373 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC098617.1-205ENST00000595918 1032 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC01198-207ENST00000598084 881 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC091769.2-201ENST00000605385 479 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC245014.3-201ENST00000618589 347 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SSX4B-202ENST00000619890 1092 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 SSX4-202ENST00000620320 1092 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AL353684.1-201ENST00000622677 1120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP001052.1-201ENST00000626421 99 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC119674.1-217ENST00000641942 1086 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AQP9-202ENST00000536493 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MELK-210ENST00000543751 2400 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PPBPP2-201ENST00000513150 1362 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MS4A3-201ENST00000278865 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 RPGRIP1L-212ENST00000621565 6038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC120036.2-201ENST00000509729 1474 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC02352-202ENST00000559292 1450 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 FOXN2-201ENST00000340553 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PAK3-201ENST00000262836 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC138907.8-201ENST00000623981 2256 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RTL8BQ17RB0 QRSL1P1-201ENST00000400977 1540 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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