Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC083795.1-201ENST00000491760 320 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RN7SL568P-201ENST00000493069 298 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 NPM1P21-201ENST00000513394 762 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AP004609.2-201ENST00000532177 190 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC023389.2-201ENST00000580031 955 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 HIRAP1-201ENST00000605318 787 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 TCF12-205ENST00000537840 1598 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 SCN2A-202ENST00000375427 8553 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 DYNC1I2-202ENST00000397119 2604 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RBMX-203ENST00000431446 2004 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ZCCHC8-201ENST00000536306 2904 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RNU1-134P-201ENST00000362935 165 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RNU1-136P-201ENST00000384181 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC079809.1-201ENST00000415468 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC099677.3-201ENST00000427081 395 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AL136231.1-201ENST00000429407 730 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC108479.1-201ENST00000431142 427 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 TRGC2-201ENST00000436911 1013 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 FTLP8-201ENST00000446770 267 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC106822.1-201ENST00000502647 526 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC097110.1-201ENST00000507344 768 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 OR4A41P-201ENST00000533053 928 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ASB8-202ENST00000535055 657 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC084880.3-201ENST00000535921 541 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ASB8-203ENST00000535988 679 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 LINC01579-205ENST00000556447 791 ntTSL 4 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC121758.1-202ENST00000556917 658 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC023905.1-201ENST00000559799 1178 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 SMIM12P1-201ENST00000603004 274 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 Metazoa_SRP.111-201ENST00000614073 259 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AL512652.1-201ENST00000619006 500 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-360ENST00000630377 598 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PDK4Q16654 SLC16A6-201ENST00000327268 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 MTCO1P28-201ENST00000574177 1528 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC016747.4-201ENST00000462959 1383 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 FGL1-209ENST00000522444 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL359538.1-201ENST00000453498 1710 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 CRYBA1-201ENST00000225387 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 DEFB126-201ENST00000382398 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC068286.1-201ENST00000416173 467 ntTSL 4 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC092168.1-201ENST00000443030 236 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 TRIM60P16-201ENST00000444048 694 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 PPIAP7-201ENST00000454070 489 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 AP000620.1-201ENST00000527147 504 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PDK4Q16654 LINC02345-203ENST00000558897 405 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms