Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SCARNA6.1-201ENST00000516989 238 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 IGHV3-36-201ENST00000520848 401 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC015722.1-201ENST00000557499 385 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL022318.2-201ENST00000558766 258 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC004147.5-201ENST00000581727 536 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC091132.5-201ENST00000590995 560 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 RNF157-207ENST00000592271 755 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 EDRF1-AS1-202ENST00000593871 592 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 MIR6754-201ENST00000621121 66 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 IGHV3-54-201ENST00000622166 353 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC005086.2-201ENST00000624939 228 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 TACC2-210ENST00000369005 9673 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PRAMEF10-201ENST00000235347 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PRAMEF33-201ENST00000437300 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 ADAMTS9-AS1-206ENST00000493124 1511 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 DST-206ENST00000370788 17657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 BCO2-208ENST00000526088 1983 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 DNTT-202ENST00000630152 1954 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 AC121761.1-201ENST00000547326 1482 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 SCMH1-203ENST00000361191 2906 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
MKRN4PQ13434 PSG8-202ENST00000401467 1686 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MINDY3-201ENST00000277632 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 DCAF1-202ENST00000423656 5946 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 PCDH15-223ENST00000495484 1896 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 GABPA-201ENST00000354828 5120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 EPS15L1-212ENST00000597937 3486 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 CAB39L-202ENST00000355854 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ASPA-201ENST00000263080 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 MAN1A2-201ENST00000356554 8576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 HPS5-203ENST00000396253 4725 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 S100A7-201ENST00000368722 442 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 VNN3-208ENST00000427187 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC022400.2-201ENST00000446730 866 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 AC004947.1-202ENST00000457000 576 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC110994.1-201ENST00000468519 406 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 MIR3187-201ENST00000583431 70 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ZNF160-214ENST00000601421 4688 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC073657.1-201ENST00000607504 316 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC011389.3-201ENST00000623273 999 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC087645.3-201ENST00000624708 587 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 OLFM5P-201ENST00000411807 1478 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
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MKRN4PQ13434 ACLY-202ENST00000353196 4318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 THSD7B-201ENST00000272643 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 AL049840.1-201ENST00000498989 1404 ntTSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ZNF415-202ENST00000421033 2402 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 ATP8B1-201ENST00000283684 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 EFTUD2-223ENST00000592576 3364 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
MKRN4PQ13434 EYA1-206ENST00000388743 2199 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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