Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 PSMD8P1-201ENST00000436275 769 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 IKZF3-212ENST00000439016 1246 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPL23AP40-201ENST00000487630 390 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TRBV5-2-201ENST00000489095 273 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CD200R1-205ENST00000490004 778 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC010168.1-201ENST00000501178 657 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01484-201ENST00000517733 555 ntTSL 4 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC040970.1-202ENST00000517908 505 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MRE11-209ENST00000540013 1212 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPARP-AS1-204ENST00000594818 445 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL356580.1-201ENST00000604129 159 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC073218.2-202ENST00000605962 617 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL589740.1-209ENST00000607032 1056 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 DNM1L-201ENST00000266481 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 HELLS-205ENST00000394036 3131 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CCDC26-201ENST00000446592 1721 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC126755.2-201ENST00000545114 1522 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CRB1-203ENST00000367400 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PIGN-247ENST00000640540 4720 ntTSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF610-202ENST00000327920 1855 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 EIF3EP1-201ENST00000433978 1316 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 RRH-201ENST00000317735 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC008163.1-201ENST00000636281 1455 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 RPL34P33-201ENST00000486062 334 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 TDGP1-201ENST00000543961 1229 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC093510.2-201ENST00000562820 896 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC026462.3-201ENST00000565153 557 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
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GPS1Q13098 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SYNJ2BP-COX16-205ENST00000621525 929 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 OXSM-209ENST00000626005 309 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 SLC38A1-211ENST00000612161 1607 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 MMP12-201ENST00000571244 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 IFI16-204ENST00000368131 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
GPS1Q13098 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
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