Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RPL7P61-201ENST00000451721 751 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AP003469.1-202ENST00000521884 478 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC016993.1-201ENST00000547033 1258 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC103810.5-201ENST00000581622 560 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC087763.1-201ENST00000603391 286 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC003992.1-201ENST00000635364 557 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC087269.2-201ENST00000641764 975 ntBASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SUPT20H-224ENST00000542180 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NREP-206ENST00000447165 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01741-201ENST00000427173 1666 ntTSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.77□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GAS2-201ENST00000278187 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PBRM1-202ENST00000337303 4825 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 BORCS7-ASMT-201ENST00000299353 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 DMD-228ENST00000541735 7080 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF607-202ENST00000395835 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PCLO-203ENST00000423517 17147 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 FLG-201ENST00000368799 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RNU6ATAC18P-201ENST00000408413 101 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC099654.1-202ENST00000415836 564 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC073333.1-201ENST00000418907 648 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MIR646HG-202ENST00000426753 651 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC013733.1-201ENST00000449835 985 ntTSL 4 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RAB28P2-201ENST00000454299 641 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TRIM36-IT1-201ENST00000503723 881 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC063979.2-201ENST00000513767 958 ntTSL 5 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC106800.2-201ENST00000514009 1103 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC087664.2-202ENST00000521274 515 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AL157756.1-203ENST00000553269 600 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC087477.5-202ENST00000560242 389 ntTSL 3 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC016747.2-201ENST00000605902 364 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.43-201ENST00000616394 271 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 Metazoa_SRP.172-201ENST00000621807 265 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 STAMBPL1-201ENST00000371922 1899 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NXF2B-204ENST00000618302 2884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 OLFM3-202ENST00000370103 3255 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RAI14-228ENST00000515799 3486 ntTSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SLAMF1-202ENST00000302035 4006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ZNF571-205ENST00000590751 1700 ntTSL 2 BASIC6.76□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CHD6-203ENST00000373233 10818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NCAPG2-202ENST00000409339 5253 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 NHS-205ENST00000617601 8163 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TBC1D23-205ENST00000475134 2074 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 HUWE1-203ENST00000342160 14796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 FBXL17-203ENST00000496714 3773 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 ARMCX5-202ENST00000372742 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 TCF7L2-220ENST00000543371 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC000095.2-201ENST00000424407 768 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01798-203ENST00000428590 553 ntTSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC092916.1-201ENST00000497896 411 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC098799.1-201ENST00000504752 800 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC021678.3-201ENST00000517893 476 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 EIF5AL1-201ENST00000520547 3840 ntAPPRIS P1 BASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
SREBF2Q12772 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.2 ms