Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 IQCJ-SCHIP1-205ENST00000527095 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MTCO1P11-201ENST00000429111 1528 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 INTS12-211ENST00000618810 1502 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZCCHC6-206ENST00000375963 5379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL136984.1-201ENST00000607611 1893 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CFAP61-201ENST00000245957 4082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF254-207ENST00000613065 4244 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 IL31RA-202ENST00000354961 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 BRIP1-201ENST00000259008 6048 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 IQCG-201ENST00000265239 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 VEGFD-201ENST00000297904 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF644-204ENST00000370440 5702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TRAV19-201ENST00000390447 467 ntAPPRIS P1 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TMEM200A-202ENST00000392429 5017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SGMS2-203ENST00000394686 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF365-203ENST00000395249 433 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF630-202ENST00000409324 2455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CDY8P-201ENST00000428380 1279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL353662.1-201ENST00000439099 327 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC02096-201ENST00000445035 953 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CDY20P-201ENST00000447528 1279 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC007998.1-201ENST00000474156 672 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC093719.1-201ENST00000480427 441 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RPEP1-201ENST00000504507 658 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ADAM5-208ENST00000505455 1998 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC106864.2-201ENST00000505632 740 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TPT1-AS1-206ENST00000519454 709 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AP002001.1-201ENST00000526101 1759 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL355075.2-201ENST00000555435 478 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01568-202ENST00000555721 1325 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 RPA2P1-201ENST00000556557 721 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 Z98949.1-210ENST00000597548 766 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL354718.1-201ENST00000619764 589 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC009120.2-204ENST00000621548 2032 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC007683.2-201ENST00000624681 714 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 POLR1D-218ENST00000636817 4592 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 DSC1-201ENST00000257197 4271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 GIGYF2-246ENST00000629305 7878 ntTSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 PMFBP1-202ENST00000355636 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ZNF92-201ENST00000328747 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 DPY19L1P1-201ENST00000417811 2594 ntBASIC6.12□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LZTFL1-201ENST00000296135 4073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 OR7A10-202ENST00000641129 1847 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC003975.1-201ENST00000411856 837 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL713922.1-201ENST00000416477 747 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC6.11□□□□□ -1.43
E2F1Q01094 LDHAP2-201ENST00000437325 985 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms