Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC6.2□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PDZK1P1-202ENST00000425209 1350 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 OR52B6-201ENST00000345043 1008 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL121977.1-201ENST00000401636 979 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 HAO2-IT1-201ENST00000419144 311 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC023481.1-201ENST00000435368 938 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MEOX2-AS1-201ENST00000442176 697 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL021940.1-201ENST00000454271 677 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PWRN1-206ENST00000565512 433 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC008750.7-201ENST00000600765 559 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL031601.1-201ENST00000605702 394 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 C5orf64-203ENST00000505642 2970 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF26-202ENST00000534834 4853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RYR2-201ENST00000360064 14850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL035660.1-201ENST00000422041 222 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NDUFS5P5-201ENST00000437256 321 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL583854.1-201ENST00000438818 613 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MACROD2-IT1-201ENST00000448536 665 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 RERG-AS1-201ENST00000541243 337 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC079907.2-202ENST00000547004 423 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC108865.2-201ENST00000606881 432 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 FO681491.1-202ENST00000623392 737 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PHTF2-207ENST00000424760 1977 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 IFI16-202ENST00000340979 2732 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PSG4-201ENST00000244295 1629 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 TCF7L2-219ENST00000542695 4136 ntTSL 5 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 MIR1203-201ENST00000408812 85 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC066692.1-201ENST00000421721 457 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AL137186.1-201ENST00000440436 480 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.17□□□□□ -1.42
ACADSBP45954 ZCCHC10-203ENST00000504170 325 ntTSL 1 (best) BASIC6.17□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms