Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 LINC01606-203ENST00000519160 2292 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL080276.2-201ENST00000637995 2090 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RTN4-205ENST00000394609 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL356361.1-201ENST00000400943 1459 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NFE2L2-204ENST00000423513 1382 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC111188.2-201ENST00000529697 1387 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SCGB1A1-201ENST00000278282 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPS7-201ENST00000304921 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CLEC4A-202ENST00000345999 841 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RNA5SP396-201ENST00000364834 120 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SLAMF6-201ENST00000368055 730 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 DEFB121-202ENST00000376314 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PCOTH-201ENST00000382133 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL36A-202ENST00000392994 691 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PPP1R17-202ENST00000409146 569 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RNU4-64P-201ENST00000410795 131 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 TAS2R2P-201ENST00000421146 910 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL12P16-201ENST00000431098 498 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 HBBP1-201ENST00000433329 439 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ELOCP11-201ENST00000436690 332 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC091730.1-201ENST00000440455 692 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009237.4-201ENST00000441078 238 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ELOCP16-201ENST00000444494 332 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CYCSP44-201ENST00000448560 313 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC01831-201ENST00000449772 493 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 ATP5G1P6-201ENST00000451206 412 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC00652-202ENST00000454749 963 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPS27AP2-201ENST00000457576 465 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC009411.2-201ENST00000458359 539 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 snoU109.3-201ENST00000459477 145 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PABPC1P10-201ENST00000464731 381 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PRDX3P4-201ENST00000470828 747 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC117394.1-201ENST00000477323 567 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC109439.2-201ENST00000502421 564 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 UBE2V1P12-201ENST00000503954 474 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC00589-202ENST00000518623 938 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC018523.1-201ENST00000534211 512 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 YWHABP2-201ENST00000540201 713 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC011611.6-201ENST00000547483 255 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC011595.1-201ENST00000548901 753 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 COX6CP11-201ENST00000555293 229 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR4F28P-201ENST00000559128 938 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 LINC02188-201ENST00000562064 550 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC027688.2-201ENST00000569009 511 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CCDC58P1-201ENST00000578567 430 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR4F8P-201ENST00000589943 937 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PINLYP-206ENST00000599207 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC036176.3-201ENST00000602456 418 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL683813.2-201ENST00000605245 502 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL512413.1-201ENST00000606489 382 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC090948.2-201ENST00000607363 564 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 FAM27E3-202ENST00000614611 340 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.170-201ENST00000616060 254 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR1N1-202ENST00000619659 939 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PBX1-221ENST00000612123 6062 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CAMK2D-202ENST00000342666 1940 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 CYP2C8-201ENST00000371270 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 NUMB-204ENST00000535282 3198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 PUM2-201ENST00000319801 6002 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
VPREB1P12018 MFSD8-256ENST00000641949 1640 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms