Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIW0

VAX2, Ventral anterior homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX2Q9UIW0 AC092675.1-203ENST00000454230 538 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL356157.1-201ENST00000456722 732 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 RPS7P11-201ENST00000484240 586 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AF305872.1-201ENST00000485217 471 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 RN7SL868P-201ENST00000485915 303 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC010409.2-201ENST00000505780 478 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC021146.10-201ENST00000515628 706 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 RN7SKP196-201ENST00000516267 345 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CASP1P2-201ENST00000526830 1258 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL133399.1-201ENST00000527476 298 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01559-203ENST00000531049 683 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 WBP2NL-210ENST00000543212 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC023161.1-201ENST00000549532 420 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 NF1P12-201ENST00000549593 583 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 UBE2N-204ENST00000549833 960 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC020704.1-201ENST00000559394 454 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01917-201ENST00000565170 1037 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CHMP1B-AS1-201ENST00000586474 553 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC008543.3-201ENST00000586983 491 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL139124.1-201ENST00000609123 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC243829.2-201ENST00000617914 470 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 JAKMIP2-AS1-202ENST00000627433 831 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC007842.1-201ENST00000597336 2039 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC007878.1-201ENST00000434786 1615 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC095038.1-201ENST00000429248 1591 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CROT-204ENST00000442291 1993 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CEPT1-211ENST00000615636 1966 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 MYBPC1-221ENST00000551300 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 USP40-202ENST00000409945 1946 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 OR7D4-201ENST00000308682 1022 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CLEC12A-202ENST00000350667 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 MYO3A-202ENST00000376301 727 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 SNORA81-201ENST00000408493 178 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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VAX2Q9UIW0 AC091492.1-201ENST00000419844 272 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 LINC01105-205ENST00000450794 580 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CBX5P1-201ENST00000468470 561 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 UOX-201ENST00000471089 899 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 EIF4E2P2-201ENST00000492033 736 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 HLTF-AS1-201ENST00000492461 415 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC011405.1-203ENST00000510110 1067 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 SEPT10P1-201ENST00000517342 1162 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 OLR1-210ENST00000544577 924 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 CBX5-204ENST00000550411 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC007950.1-201ENST00000560465 615 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC092718.2-202ENST00000566390 556 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 AC126323.4-201ENST00000566935 234 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
VAX2Q9UIW0 ZNF971P-202ENST00000568619 461 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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