Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC092967.1-201ENST00000449016 481 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ACA64.1-201ENST00000459171 127 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC114728.1-201ENST00000488289 483 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC010260.1-201ENST00000511484 664 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC087360.1-201ENST00000518788 616 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC011632.2-201ENST00000520696 738 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC092865.1-201ENST00000544395 1023 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC012050.1-201ENST00000558185 472 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL133410.1-201ENST00000574939 546 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC130371.1-201ENST00000577023 230 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 AC090236.2-201ENST00000587933 1101 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC090772.4-201ENST00000623599 362 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 MIR4302-201ENST00000638058 60 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 C9-201ENST00000263408 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 LGSN-204ENST00000622415 1612 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AC009804.2-201ENST00000637566 3032 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 ST7-203ENST00000393443 2360 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RBMY1HP-201ENST00000382759 1389 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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ZNF548Q8NEK5 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPL6-201ENST00000202773 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNFT1P3-201ENST00000340898 1052 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP284-201ENST00000384547 118 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 AL355300.1-201ENST00000412439 187 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
ZNF548Q8NEK5 RPS26P38-201ENST00000414476 348 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
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