Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 FAM71F1-207ENST00000485070 1574 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 FAM71F1-209ENST00000621392 1591 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BDNF-207ENST00000395986 3979 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RNA5SP429-201ENST00000363688 109 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 VTA1P1-201ENST00000414044 866 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC00362-201ENST00000414345 264 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL18AP14-201ENST00000417685 526 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC105275.1-201ENST00000417794 491 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 PHB2P1-201ENST00000434943 890 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC114814.1-201ENST00000444926 691 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC003035.2-201ENST00000448948 696 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC006026.3-201ENST00000454029 143 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL035443.1-201ENST00000456631 304 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL133480.2-201ENST00000456723 487 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC010655.2-201ENST00000493710 662 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC104971.1-201ENST00000495117 578 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC096661.1-201ENST00000515870 822 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 H2AFV-208ENST00000521529 439 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AP002004.1-202ENST00000528437 586 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC108471.2-203ENST00000532680 517 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 DDIT3-204ENST00000551116 1067 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL109628.1-201ENST00000556877 366 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 PPIAP6-201ENST00000557078 499 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC009019.1-202ENST00000568410 405 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MIR8082-201ENST00000612488 81 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 VN1R7P-201ENST00000619242 903 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 PPP3CB-AS1-215ENST00000620559 656 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC079298.3-203ENST00000623269 555 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
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ECM1Q16610 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 SLF2-202ENST00000370269 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 VIT-206ENST00000457137 1344 ntTSL 1 (best) BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LINC01677-204ENST00000635342 1329 ntTSL 5 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AP003119.3-201ENST00000566747 4192 ntBASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.73□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TAT-201ENST00000355962 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ADGRL3-214ENST00000511324 5042 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 NUMB-203ENST00000359560 3309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AMY1A-201ENST00000370083 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TMEM267-201ENST00000397080 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 LRP2BP-202ENST00000505916 2302 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 ZBED3-AS1-216ENST00000515356 1987 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 OR10R2-201ENST00000368152 1008 ntAPPRIS P2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL672167.2-201ENST00000377164 879 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 REV3L-IT1-201ENST00000411895 382 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC009518.3-201ENST00000438972 253 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC015983.1-201ENST00000441577 373 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL445307.1-201ENST00000446476 602 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL137005.1-201ENST00000452944 719 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BBIP1-208ENST00000454061 812 ntTSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AL096803.1-201ENST00000456921 1021 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 SOX2-OT-210ENST00000487240 751 ntTSL 5 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 AC021088.1-201ENST00000506519 805 ntTSL 3 BASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
ECM1Q16610 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC7.72□□□□□ -1.17
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