Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 FBXW7-203ENST00000296555 3572 ntTSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 NDST4-204ENST00000613194 3439 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 MEPE-209ENST00000560249 2206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LEMD1-203ENST00000367152 741 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 APOOL-201ENST00000373173 1279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AP003170.5-201ENST00000397185 335 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 TBC1D32-204ENST00000398212 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC015977.1-201ENST00000418887 292 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RIMS1-205ENST00000414192 1787 ntTSL 2 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZNF484-204ENST00000395506 4031 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 IL2RA-203ENST00000379959 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZNF462-201ENST00000277225 10414 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 CLEC4E-201ENST00000299663 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 CA5B-201ENST00000318636 6835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 AL022337.1-201ENST00000434510 357 ntTSL 3 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 SORBS1-203ENST00000354106 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.33□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 AL627309.5-201ENST00000484859 4860 ntTSL 5 BASIC7.32□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 CCDC162P-202ENST00000368966 6751 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZNF718-201ENST00000510175 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 GBP1-201ENST00000370473 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC060780.1-202ENST00000590740 5084 ntTSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
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CHD4Q14839 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 OR13K1P-201ENST00000444577 975 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 RPS27AP3-201ENST00000453803 454 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 AC244502.2-201ENST00000543361 851 ntBASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ZNF112-202ENST00000354340 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ALKBH8-205ENST00000428149 4079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.31□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 MAPK1IP1L-201ENST00000395468 6480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
CHD4Q14839 ATOX1-203ENST00000521264 4341 ntTSL 2 BASIC7.3□□□□□ -1.24
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