Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MIR4776-2-201ENST00000580204 80 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL139099.4-201ENST00000614802 114 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MVP-219ENST00000629059 120 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TOPORSLP1-201ENST00000467693 2102 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CLMN-201ENST00000298912 12747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BPIFC-201ENST00000300399 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NOVA1-206ENST00000539517 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TAS2R16-201ENST00000249284 997 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 OR7G2-201ENST00000305456 1038 ntAPPRIS P2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CRYGS-201ENST00000307944 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HNMT-203ENST00000329366 835 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SUGT1P2-201ENST00000379452 992 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TRAJ25-201ENST00000390512 60 ntAPPRIS P1 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL391704.3-201ENST00000425365 831 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RPL5P10-201ENST00000445207 894 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL359839.1-201ENST00000451975 1160 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC090589.1-201ENST00000473109 362 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC007346.2-201ENST00000564816 892 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HCFC2P1-201ENST00000392864 1592 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 UGT2B24P-201ENST00000514441 1597 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ZNF107-201ENST00000344930 5174 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PTPRR-204ENST00000440835 2818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 CX3CR1-201ENST00000358309 3151 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FMN1-212ENST00000616417 13529 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 C9orf153-202ENST00000376001 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 OR7E156P-201ENST00000400303 464 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC02246-202ENST00000418954 717 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DCN-205ENST00000441303 519 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AC060775.1-201ENST00000518241 520 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 AP000648.1-201ENST00000529682 397 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 TCEANC-205ENST00000544987 1146 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
RFTN1Q14699 LINC02412-201ENST00000552584 1269 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.4 ms