Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 AC093599.1-201ENST00000515232 562 ntTSL 4 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 LINC00534-203ENST00000523406 812 ntTSL 3 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AJ009632.2-207ENST00000634659 527 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC010894.3-202ENST00000412835 1405 ntTSL 2 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 GABRA3-204ENST00000535043 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CREB5-201ENST00000357727 8532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 TRAPPC2-203ENST00000380579 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.29□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 PIK3C3-202ENST00000398870 9206 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 IFIT2-203ENST00000638108 3703 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 VEZT-204ENST00000436874 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZNF28-201ENST00000339844 650 ntTSL 4 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC121334.1-201ENST00000396414 802 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL157702.1-201ENST00000398764 426 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 DHFRP2-201ENST00000414224 547 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL360013.1-201ENST00000419031 858 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC073508.1-201ENST00000428866 656 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC087672.1-201ENST00000479876 766 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR9A1P-202ENST00000484361 945 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 IGKV2-19-201ENST00000518132 283 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC079089.1-204ENST00000530194 572 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC078922.1-201ENST00000547547 434 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL133163.3-201ENST00000556448 504 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ARPP19-204ENST00000563277 955 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL662797.2-201ENST00000607333 527 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AFF2-203ENST00000370457 3952 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC084816.1-210ENST00000540895 1920 ntTSL 2 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 NBPF12-206ENST00000617844 6326 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 AC097512.1-201ENST00000511453 1309 ntTSL 3 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 ATP13A4-204ENST00000400270 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.28□□□□□ -0.92
NEUROD1Q13562 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ATP2C1-203ENST00000422190 3386 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 FAM32BP-201ENST00000344033 333 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TINAG-203ENST00000370869 782 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC139712.3-201ENST00000443926 639 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC097359.1-201ENST00000447946 463 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MAGI2-AS3-210ENST00000448636 798 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01596-201ENST00000503609 592 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 HMGN1P16-201ENST00000508308 283 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 DEFB134-202ENST00000526438 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC005632.2-201ENST00000564271 828 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZNF814-214ENST00000600634 461 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AL513314.2-202ENST00000617077 536 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 SLAMF6-203ENST00000368059 2743 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 AC233968.1-201ENST00000611212 1300 ntBASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC9.27□□□□□ -0.93
NEUROD1Q13562 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.93
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