Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 GRIP1-202ENST00000398016 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC090673.1-202ENST00000356215 4617 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PLSCR2-201ENST00000336685 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 METTL5-205ENST00000409837 936 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CASC22-201ENST00000569713 386 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC005972.4-201ENST00000636248 1131 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.64□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 GNS-202ENST00000418919 4877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MBNL2-202ENST00000345429 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 MARVELD2-204ENST00000454295 4376 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SORBS1-219ENST00000607232 4374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CASC19-248ENST00000641674 1356 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 EP400-204ENST00000389561 12317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CAST-203ENST00000338252 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 TLN2-209ENST00000561311 11880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SYTL2-208ENST00000524452 2733 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC092724.1-201ENST00000624623 3397 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 POLA1-201ENST00000379059 5440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 POLA1-206ENST00000611764 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 USP37-205ENST00000454775 5019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 DHX32-201ENST00000284690 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CCDC169-202ENST00000239860 716 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 GABRG3-201ENST00000333743 1235 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC244035.2-201ENST00000425896 630 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 DUTP1-201ENST00000493631 470 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 CCDC169-211ENST00000503173 837 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 AC113386.1-201ENST00000523584 381 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 AP002370.2-202ENST00000533669 908 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 PLAGL1-205ENST00000392307 6296 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
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TCOF1Q13428 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 SRSF1P1-201ENST00000424058 520 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC107057.1-201ENST00000425763 319 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 LINC01911-201ENST00000450667 806 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RPSAP50-201ENST00000481955 852 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 EIF1P7-201ENST00000487533 337 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC093890.1-201ENST00000502554 540 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AL671862.1-201ENST00000515851 349 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 RN7SKP66-201ENST00000516681 231 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC090109.1-201ENST00000548885 819 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
TCOF1Q13428 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
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